W dniu 11.10.2017 r. na nadzwyczajnym posiedzeniu Rady Wydziału Inżynierii Środowiska Politechniki Krakowskiej nadała dr inż. Jerzemu Mikoszowi stopień doktora habilitowanego za osiągnięcie naukowe w postaci cyklu puublikacji zatytułowanego  „Teoretyczne i praktyczne aspekty matematycznego modelowania procesu wielofazowego osadu czynnego z uwzględnieniem emisji N₂O”. Tym samym Rada Wydziału doceniła wkład dr inż. J. Mikosza w rozwój dyscypliny naukowej Inżynierii środowiska polegający na określeniu zasad racjonalnej aplikacji modeli cząstkowych, w tym modeli opisujących emisję N₂O, w kompleksowym modelu oczyszczalni ścieków miejskich podczas badań symulacyjnych. Zrealizowane przez niego badania własne miały charakter nowatorski, a sformułowane wnioski mogą stanowić podstawę do racjonalnego planowania badań symulacyjnych w oczyszczalniach ścieków miejskich. Uzyskane wyniki badań pozwoliły na określenie zasad doboru modeli cząstkowych, zakresu ich uwzględnienia w modelu kompleksowym oczyszczalni oraz sposobu realizacji poszczególnych etapów badań symulacyjnych w zależności od wyznaczonego celu badań. Chociaż takie próby były podejmowane w przeszłości i na ich podstawie formułowano pewne rekomendacje, to jednak dotyczchczas brak było kompleksowych zaleceń odnośnie zasad  modyfikowania poszczególnych etapów badań w celu ich uproszczenia i racjonalizacji, gdy jest to uzasadnione celem  i specyficznymi uwarunkowaniami prowadzonych badań. Przewodniczącym Komisji Habilitacyjnej był prof. dr hab. inż. Wojciech Janczukowicz, a recenczentami w postępowaniu habilitacyjnym byli prof. dr hab. inż. Hanna Obarska-Pempkowiak, prof. dr hab. inż. Ryszard Błażejewski​ oraz dr hab. inż. Ryszard Szetela, prof. P.Wr.